RNA-Seq解析では解析報告書に加えてリード情報のほか、マッピングデータやジャンクション構造予測データ、転写物データなどがデータHDDで納品されます。

データHDDには発現レベル比較データも含まれており、エクセルによるマクロファイル形式とテキストファイル形式での納品です。

同じくデータHDDに含まれるGO解析データはテキスト形式になります。

サンプル条件は精製TotalRNA以外はライブラリ作製キットによって異なり、RNA量や濃度、RIN値などが制限される可能性があります。

バイオアナライズによる電気泳動図を所持している場合は提供を推奨する他、同時解析を行うサンプル例が多数となる場合には別途打ち合わせを行っているため注意しましょう。

理研ジェネシスのRNA-Seq解析では、次世代シーケンサーによる全転写物の塩基配列の決定や、転写物のアセンブリングと発現レベルの算出などを行います。

さらには転写物のアノテーション付与などが可能です。

解析の特徴としては、遺伝子発現レベルだけではなくプライシングパターンの解析を実施できる点などが挙げられるでしょう。

遺伝子発現変動の網羅的な解析を行うことで、遺伝子発現パターンの同定も可能となりました。

またGO解析とパスウェイ解析の組み合わせや融合遺伝子の探索も可能です。

RNA品質や解析の目的などにより、幅広い用途に活用できるのがRNA-Seq解析の魅力となっています。